
時間:2021-03-04 瀏覽:1540次
全基因組DNA甲基化測序
全基因組DNA甲基化測序(Whole Genome Bisulfite Sequencing,WGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina高通量測序平臺相結合,對有參考基因組的物種在全基因組水平進行高精準甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態,從而構建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。
基于全基因組重亞硫酸鹽轉化的WGBS法,實現單堿基分辨率的甲基化位點精準、高效定位。精準獲得全基因組甲基化的C位點,是甲基化測序的金標準;全面分析不同處理對全基因組甲基化水平的影響,快速準確地找到差異甲基化區域。具有“高效、精準、超值”的優勢,已廣泛應用于人和動植物研究。
WGBS |
分析內容 |
解決問題 |
標準分析 |
測序數據質量評估 |
過濾掉低質量數據,保證數據質量 |
與參考基因組比對 |
比對率和覆蓋度分析 |
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甲基化位點calling |
分析甲基化位點 |
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甲基化分布 |
甲基化在基因組,染色體,功能元件上的分布 |
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差異甲基化分析 |
尋找DMR |
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相關基因分析 |
相關基因GO,KEGG富集分析 |
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多樣本分析 |
PCA分析多樣本甲基化變化規律 |
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