建立病毒檢測的新技術基本上應從3個方面考慮,即對病毒抗原的檢測、對病毒產生抗體的檢測和對病毒基因的檢測。除亞病毒外,病毒體主要由核酸和蛋白質組成,核心為核酸,為病毒增殖、遺傳與變異等功能提供信息,是病毒存在所必需的。于待檢者體內檢測到病毒核酸的存在,是證明病毒感染的直接指標。病毒核酸由DNA和RNA組成,兩者不共存于同一病毒顆粒內。病毒DNA和RNA還有雙鏈與單鏈、正鏈與負鏈、雙線狀與線狀以及分節段與不分節段之分。隨著分子生物學技術的發展,很多病毒的核酸序列已被弄清楚[4],20世紀80年代初期,建立了核酸分子雜交法。例如,利用非放射性探針建立的檢測HCVRNA的方法。同時利用探針結合原位雜交(Situhybridization)檢測組織或細胞內的病毒RNA對病理診斷及治療均有很大幫助。

病毒基因檢測系統，以聚合酶鏈式反應（簡稱PCR）技術為核心，通過體外快速擴增DNA的方法，用于放大特定的DNA片段，數小時內可使目的基因片段擴增到數百萬個拷貝。這樣就能準確的檢測病毒的基因數，以此換算病毒量。

目前多應用于乙肝病毒量的檢測以及HIV病毒基因（即HIV核酸檢測）檢測之中。
HIV核酸檢測是利用分子生物學的理論和技術，通過直接探查病毒核酸的存在與否，從病毒的核酸結構來分析核酸的功能，從而對人體狀態與疾病做出診斷的方法。它的目標分子是DNA或RNA，反映核酸的結構和功能，用于診斷有無病原體感染，是目前世界上最先進、最精確的疾病檢測手段。